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只需几周,大规模检测蛋白质相互作用加州 [复制链接]

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▎药明康德内容团队编辑

近日,加州大学圣地亚哥分校(UCSD)钟声教授带领的团队开发了一项名为PROPER-seq的新技术,通过DNA测序,大规模检测蛋白质之间的相互作用。采用这个技术,一个普通的实验室用几周时间就能测出他们关心的细胞的整个蛋白相互作用网络。▲研究论文发表于权威学术期刊MolecularCell(图片来源:论文截图)PROPER-seq技术的核心是把所有的蛋白质相互作用以DNA标记起来,然后利用高通量DNA测序来解码。为了实现这一想法,对于想要研究的细胞,研究人员首先开发了一种SMART-display技术,给细胞内的每个蛋白质贴上一段独特的DNA条形码。第二个关键步骤称为“孵化、连接和测序”(INLISE),给所有具有相互作用的蛋白质上的成对DNA条形码进行测序。最后,结合统计工具,从测序数据中解码蛋白质之间的相互作用。据这项研究的第一作者KaraJohnson博士说:“PROPER-seq能够在一次实验中扫描10,×10,个蛋白质对的数量级。”▲PROPER-seq技术示意图:由两个步骤组合起来检测蛋白质之间的相互作用(图片来源:参考资料[1])PROPER-seq的应用目前已在多种类型的细胞中得到检验,包括人胚胎肾细胞(HEKcell)、T淋巴细胞和内皮细胞。研究人员总共鉴定出了超过21万对蛋白质相互作用,并收录在新建的数据库中(
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